Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms