Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSGALNACT2Q8N6G5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms