Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM71E2Q8N5Q1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71E2Q8N5Q1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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