Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms