Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDZD4Q76G19 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms