Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM5Q71RC9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms