Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP31Q70CQ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
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