Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHLRC1Q6VVB1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHLRC1Q6VVB1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms