Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VITQ6UXI7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms