Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms