Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC174Q6PII3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC174Q6PII3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms