Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6P435 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6P435 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6P435 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6P435 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6P435 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6P435 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6P435 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6P435 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms