Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARMIL2Q6F5E8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARMIL2Q6F5E8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms