Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHEQ5VZ18 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms