Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC38Q502W7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms