Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms