Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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