Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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