Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms