Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EMC2Q15006 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EMC2Q15006 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EMC2Q15006 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms