Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAPSNQ13702 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAPSNQ13702 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms