Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
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