Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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