Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLF1Q13351 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms