Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPA4Q13156 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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