Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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STRN3Q13033 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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