Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms