Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FMODQ06828 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms