Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CD164Q04900 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms