Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2MP61081 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms