Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms