Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJA9P57773 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GJA9P57773 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA9P57773 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJA9P57773 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms