Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBASH3AP57075 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBASH3AP57075 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms