Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
POLR2KP53803 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2KP53803 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms