Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MYCNOSP40205 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms