Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF1P30408 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF1P30408 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms