Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB1P23443 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB1P23443 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms