Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms