Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNI3P19429 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms