Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD53P19397 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD53P19397 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD53P19397 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CD53P19397 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD53P19397 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD53P19397 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD53P19397 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD53P19397 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD53P19397 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms