Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX6B1P14854 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6B1P14854 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms