Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRF1P14222 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRF1P14222 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRF1P14222 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRF1P14222 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRF1P14222 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms