Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms