Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DEFA4P12838 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms