Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms