Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms