Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF113AO15541 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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