Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOR1AO14656 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOR1AO14656 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms