Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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