Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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